农作物论文_小麦miRNA启动子的基因组分析

文章摘要:Micro RNA（mi RNA）是一类非编码RNA,与植物的生长发育及胁迫响应密切相关。为给小麦mi RNA的转录调控以及新mi RNA的预测提供参考依据,本研究通过小麦mi RNA基因定位、启动子预测以及顺式作用元件鉴定等方法对小麦mi RNA启动子进行了基因组分析,结果表明,小麦基因组中有105个pre-mi RNA位于150个基因座上,大部分为单拷贝。148个mi RNA基因座具有潜在启动子区域,其中115个mi RNA基因至少能够预测到一个启动子。保守性及基因位置不同的mi RNA的启动子转录起始位点（TSS）分布也稍有不同,但大多数位于上游序列近端区域。对mi RNA基因TSS上游序列的顺式作用元件分析发现,mi RNA启动子区域存在与胁迫响应相关的基序,且小麦中存在3个mi RNA启动子特异性基序。61.4%的小麦mi RNA启动子区域有Cp G岛分布。

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论文分类号:S512.1

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